Η μπαταρία του iPhone 13 mini είναι τύπου ιόντων λιθίου (Li-ion) με ονομαστική χωρητικότητα 2.438 mAh. Η τάση λειτουργίας της είναι 3.83V, ενώ η συνολική ενέργεια που μπορεί να αποθηκεύσει είναι 9.34 Wh.
Παρά το γεγονός ότι το iPhone 13 mini διατηρεί το ίδιο compact μέγεθος με τον προκάτοχό του, ο νέος επεξεργαστής A15 Bionic και η μεγαλύτερη χωρητικότητα μπαταρίας εξασφαλίζουν καλύτερη αυτονομία, με διάρκεια έως 17 ώρες για αναπαραγωγή βίντεο και 55 ώρες για αναπαραγωγή ήχου.
Υποστηρίζει γρήγορη ενσύρματη φόρτιση 20W και ασύρματη φόρτιση MagSafe 12W.