Το Takumi Sumino είναι ένας εντελώς συνηθισμένος έφηβος που ζει στο Συγκρότημα Κατοικιών του Τόκιο, έναν τόπο όπου κάθε μέρα είναι παρόμοια με την προηγούμενη και δεν συμβαίνει τίποτα κακό. Όλα αλλάζουν όταν παράξενα τέρατα επιτίθενται στην πόλη και αρχίζουν να προκαλούν χάος. Ένας περίεργος χαρακτήρας που αυτοαποκαλείται Sirei εμφανίζεται και προσφέρει στον Takumi τη δύναμη να προστατέψει αυτούς που αγαπά... Το μόνο που έχει να κάνει είναι να αυτοπυροβοληθεί στο στήθος! Το επόμενο πράγμα που ξέρει είναι ότι ο Takumi βρίσκεται στην Ακαδημία Τελευταίας Άμυνας, μια σχολή που βρίσκεται στη μέση του πουθενά και περιβάλλεται από ένα τείχος υπερφυσικών φλογών. Αυτός και 14 άλλοι μαθητές έχουν επιλεγεί στην Ειδική Υπηρεσία Άμυνας, μια ομάδα που έχει αναλάβει την ευθύνη να κρατήσει το σχολείο ασφαλές για τα επόμενα 100 ημερών. Πόσο είναι διατεθειμένοι να θυσιάσουν για να επαναφέρουν τις κανονικές τους ζωές και να σώσουν τον κόσμο από τους αλλόκοτους εισβολείς του σχολείου; Η αυλαία σηκώνεται για 100 ημέρες πολέμου και απελπισίας...