Τα βιολογικά φασόλια είναι πολύ πλούσια σε φυτικές ίνες και φυλλικό οξύ (βιταμίνη Β9). Είναι καλή πηγή χαλκού, μαγγανίου, φωσφόρου, θειαμίνης (βιταμίνη Β1), πρωτεϊνών, σιδήρου και μαγνησίου. Περιέχουν επίσης βιταμίνες C και Ε, ασβέστιο, υδατάνθρακες και ιχνοστοιχεία.

Μερικά είδη φασολιών, όπως τα μαύρα φασόλια, τα κόκκινα και τα pinto, είναι πολύ πλούσια και σε μολυβδαίνιο, με ένα φλιτζάνι να μπορεί να περιέχει μέχρι και 285% της Ημερήσιας Πρόσληψης. Είναι πολύ φτωχά σε λιπαρά.

Τα βιολογικά φασόλια διαφέρουν από τα φασόλια συμβατικής καλλιέργειας λόγω της μεγαλύτερης συγκέντρωσης θρεπτικών συστατικών, ιδιαίτερα αντιοξειδωτικών, βιταμινών και ιχνοστοιχείων.