Το δεύτερο Box Set του Naruto και η αρχή της περιόδου Shippuden της ιστορίας. Αυτό το σετ περιλαμβάνει τους τόμους 28~48, προσφέροντας σημαντική εξοικονόμηση σε σχέση με την αγορά τους ατομικά, μαζί με ένα αποκλειστικό mini-comic που περιέχει την πιλότο ιστορία της σειράς και έναν πολύχρωμο, διπλής όψεως πόστερ.

Έχουν περάσει περισσότερα από δύο χρόνια από τότε που ο Naruto έφυγε για να εκπαιδευτεί με τον Jiraiya. Πολλά έχουν συμβεί τον καιρό που απουσίαζε και έχουν προκύψει νέες απειλές για τον κόσμο των νίντζα. Μπορεί ο Naruto να αποδείξει την αξία του και να σώσει τον φίλο του, Sasuke;