Η Γη βρίσκεται υπό καταστροφή και το μεγαλύτερο μέρος αυτής καίγεται. Κάπου εκεί έξω, σε αυτό που μέχρι τώρα αποκαλούσαμε "Αγνωστο Διάστημα" βρίσκεται μία εξωγήινη φυλή που σκοπός είναι να καταστρέψει ότι έχει απομείνει από τον κόσμο μας.

Είσαι ο Διοικητής Shepard και ο μόνος τρόπος για να πάρεις πίσω αυτό που ανήκει στους γήινους είναι να μαζέψεις όλες τις φυλές, να συνεργαστείτε και να εκτελέσετε μία τελευταία αποστολή ώστε να καταστρέψετε τον εχθρό. Το αν θα τα καταφέρεις είναι στο χέρι σου. Η Γη καίγεται, θα προλάβεις;